昭和
| 昭和37年 2月 8日 | 学校法人宮崎高等学校認可。宮崎高等学校設置認可 |
|---|---|
| 昭和37年 4月 1日 | 宮崎高等学校開学 |
| 昭和40年 1月 25日 | 学校法人南九州学園に名称変更。南九州短期大学英語科設置認可 |
| 昭和41年 1月 27日 | 南九州短期大学に教養科，体育科増設認可 |
| 昭和42年 2月 7日 | 南九州大学園芸学部園芸学科，造園学科設置認可 |
| 昭和49年 4月 1日 | 宮崎高等学校募集停止 |
| 昭和51年 3月 19日 | 南九州大学園芸学部に農業経済学科増設認可 |
| 昭和60年 3月 22日 | 南九州短期大学体育科廃止認可 |
平成
| 平成4年 2月 3日 | 宮崎高等学校廃止認可 |
|---|---|
| 平成10年 12月 22日 | 南九州大学大学院園芸学・食品科学研究科設置認可 |
| 平成13年 8月 1日 | 南九州大学環境造園学部設置認可（造園学科，地域環境学科） |
| 平成14年 4月 1日 | 南九州短期大学「英語科」の名称を「国際コミュニケーション学科」に変更 |
| 南九州大学園芸学部造園学科及び農業経済学科の募集停止 |
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| 平成14年 5月 29日 | 南九州大学園芸学部園芸学科収容定員増（200人→320人）認可 |
| 平成14年 7月 30日 |
南九州短期大学国際教養学科設置認可 |
| 平成14年 12月 29日 | 南九州大学健康栄養学部設置認可（管理栄養学科，食品健康学科） |
| 平成15年 4月 1日 | 南九州大学園芸学部食品工学科募集停止 |
| 南九州短期大学国際コミュニケーション学科及び教養科募集停止 |
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| 南九州大学宮崎キャンパス開設（健康栄養学部） |
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| 南九州短期大学を宮崎キャンパスに移設 |
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| 平成16年 11月 30日 | 南九州短期大学国際教養学科収容定員増（180人→220人）認可 |
| 平成18年 6月 26日 | 南九州大学園芸学部造園学科、農業経済学科及び 南九州短期大学国際コミュニケーション学科、教養科の廃止届出 |
| 平成18年 12月 7日 | 南九州大学園芸学部食品工学科廃止届出 |
| 平成20年 5月 30日 | 南九州大学環境園芸学部設置届出 |
| 南九州大学健康栄養学部管理栄養学科収容定員増届出（160人→240人） |
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| 平成20年 12月 25日 | 南九州大学大学院園芸学・食品科学研究科収容定員変更届出（24人→12人） |
| 平成21年 4月 1日 | 南九州大学園芸学部及び環境造園学部募集停止 |
| 南九州大学都城キャンパス開設（環境園芸学部） |
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| 平成21年 9月 4日 | 南九州短期大学国際教養学科収容定員増（220人→250人）認可 |
| 平成21年 10月 30日 | 南九州大学人間発達学部設置認可（子ども教育学科） |
| 平成23年 6月 28日 | 南九州大学健康栄養学部食品健康学科を食品開発科学科に名称変更届出 |
| 平成24年 4月 1日 | 南九州大学健康栄養学部食品健康学科を食品開発科学科に名称変更 |